Why are styles not displayed after cleaning the site from viruses?

Question

Drupal

Hello!
Images are loading
I cleaned the site on Drupal 7.2 from viruses, now CSS styles are not displayed and I see such errors:

Notice: Undefined index: highlighted в функции include() (строка 126 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/modules/system/page.tpl.php).
Notice: Undefined index: sidebar_first в функции include() (строка 138 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/modules/system/page.tpl.php).
Notice: Undefined index: sidebar_second в функции include() (строка 144 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/modules/system/page.tpl.php).
Notice: Undefined index: juga в функции drupal_theme_initialize() (строка 100 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Trying to get property of non-object в функции _drupal_theme_initialize() (строка 145 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Undefined index: juga в функции drupal_theme_initialize() (строка 100 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Trying to get property of non-object в функции _drupal_theme_initialize() (строка 145 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Trying to get property of non-object в функции _theme_load_registry() (строка 334 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Undefined index: juga в функции theme_get_setting() (строка 1414 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Trying to get property of non-object в функции theme_get_setting() (строка 1451 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).
Notice: Trying to get property of non-object в функции theme_get_setting() (строка 1461 в файле /home/siteru/domains/site.ru/public_html/includes/theme.inc).

In what direction to dig? What files can be skipped?